福州市有道教、佛教、基督教、天主教、伊斯兰教等5种宗教。
    秦汉时期，福州已有方仙道、黄老道踪迹。东汉末、三国孙吴时福州就出现道士活动，主要有介琰、董奉。介琰在福州修炼，侯官人董奉活动在江东一带。西晋道教宫观建立起来，太康年间冶山建有城隍庙。
    三国吴、晋之际佛教传入福州。西晋太康年间（280～289年）侯官（今福州）有药山寺，太康三年（282年）起，有灵塔寺与绍因寺，南朝宋至隋（420～618年）建有寺院51所。
    唐代是道教、佛教鼎盛时期。这时福州地区道教著名的宫观，有侯官的紫极宫、冲虚宫，罗源的洞天宫、天庆观和永泰的乌石宫等。唐贞元二十年（804年）与大中七年（853年）日僧空海及圆珍先后抵榕居贸或参学。五代时闽王王审知对佛教采取扶持政策，佛教建寺267所。著名的有闽侯雪峰崇圣寺、福州怡山西禅寺、鼓山涌泉寺、北峰林阳寺、福清黄檗山万福寺等。
五代时，高丽、日本僧人来雪峰崇圣寺、安国寺向义存、师备参学求法。
   宋朝，福州佛教更加兴旺，僧尼达万余人。
   宋、元是福州道教最兴盛时期，与江西龙虎山天师府保持密切联系，福州道士有的到龙虎山天师府学道并在那里任职。宋代最早镂版的《万寿政和道藏》出自福州。

清真寺

    福州清真寺是福州唯一的伊斯兰教寺。在福建福州市安泰桥下。据寺碑刻自称，始建于唐贞观二年（628年），不合史实。按此地原为五代时闽王继鹏的太平官，后晋天福元年（9％年）改为万寿院（佛教），元至正间站归伊斯兰教，改为清真寺。《闽都记》云：国朝初建，名“真教寺”，俗呼“礼拜”，色目人礼拜诵经于此。明嘉靖二十年（1541年）毁于火，是年冬着手重建，越八年始落成。重建的寺，届东方建筑形式；大殿单檐五脊顶，深广均五间，成正方形，为礼拜堂。前有华表，左右两庑为茶厅、房廊、厨舍等。现存大殿为1955年重建，改为工字形。寺内有永乐圣谕、嘉靖重建清真寺记等石碑。
   明洪武九年（1376年），福州清真寺正式对外开放。后清真寺毁于火，嘉靖二十八年（1549年）重建。
   明嘉靖以后，由于倭寇的不断骚扰与明末的战乱，寺院的经济成为官府缓解“军储告匮的主要渠道之一。福州的佛教一蹶不振。
   明、清后，道教开始衰微，特别在清乾隆四年（1739年）曾禁止正一真人传度。
   清朝，福州佛教向日本与东南亚传播，与日本、新加坡、马来西亚佛教有着渊源关系。清顺治十一年（1654年）高僧隐元率弟子东渡日本弘法，在日本创黄檗宗。光绪十一年（1885年）福州鼓山涌泉寺住持妙莲到马来西亚弘法，后在槟城建极乐寺。接着，西禅寺微妙禅师弟子贤慧等到新加坡，也在金桔律创建双林寺。两寺分别作为鼓山涌泉寺、怡山西禅寺廨院。
   清末，废科举办学校之风盛行，福州地区也出现改寺宇为校舍、以寺产办教育的现象，虽遭到广大教徒的强烈反对，但佛教在福州还是趋于衰散。
    民国元年4月，中华佛教总会在上海静安寺成立；民国3年5月中华佛教总会改为中华佛教会。民国17年3月成立福建省分会，会址设在于山白塔寺内，由鼓山涌泉寺本忠禅师等主持会务。

乌山道观

   天启五年（1625年），天主教由意大利耶酥会传教士艾儒略传入福州，数年后相国叶向高的长孙带头集资在福州城内宫巷建起福州历史上第一座天主堂——三山堂。崇祯七至八年间（1634～1635年），天主教的耶酥会与多明我会展开争论，前者败后者胜，福州天主教会转入多明我会之手。之后，自清雍正、乾隆、嘉庆至道光十七年间（1723～1837年），为禁教时期，禁止天主教传播，三山堂被充公改为关帝庙；闽浙总督满宝出示驱逐外国传教士，勒令奉教者改为自新；福建巡抚周学健斩福建教区主教桑白禄于西门外，使天主教在半个世纪中陷于奄奄一息之境地。
清道光十八年（1838年）天主教成立福建代牧区，即由罗马教廷直接管辖的传教区，划归西班牙多明我会。道光二十年（1840年）鸦片战争后，福州被辟为五口通商口岸之一，西方列强侵入中国，外国传教士按通商传教，且享有治外法权，外国传教士开始远涉重洋来福州传教。道光二十二年（1842年）解除禁教令。不久，天主教、基督教逐步恢复活动。道光二十七年（1847年）基督教在茶亭建真神堂，为卫理公会东亚第一堂。咸丰八年（1858年）在仓前建天安堂。
   清光绪七年（1881年），天主教福建代牧区南北分立，北境代牧区设在福州，南境代牧区设在厦门。民国13年（1924年）北境代牧区称福州牧区，民国29年升格为福州总牧区。基督教，鸦片战争后，英美等国以福州、厦门为中心进行传教，清道光二十七年（1847年）到二十世纪初在福州地区逐步形成6个教派：中华圣公会（前称安立甘会，清道光三十年，即1850年5月传入），基督教复临安息日会（宣统三年，即1911年传入），基督徒聚会处（1921年创立），真耶酥教会（1923年由湖南传入），中华基督教卫理公会（亦称美以美会，1947年9月传入），中华基督教会（原名美部会，后改为公理会，1847年传入）。
    到1949年底，福州市区（不包括所辖县、市）有教堂、寺观249座。其中天主教教堂9座；基督教教堂44座；佛教寺庙135座；伊斯兰教清真寺1座；道教宫观60座。

涌泉寺

    中华人民共和国成立后，中国共产党和人民政府认真贯彻执行宗教信仰自由政策，福州市宗教界清除教会中的帝国主义势力，实行“三自”（自传、自治、自养）的正确方针，使天主教、基督教由帝国主义的侵略工具变为中国教徒独立自主自办的宗教事业。还废除宗教封建特权的压迫剥削制度，揭露和打击披着宗教外衣的反革命分子和坏分子，佛教、道教和伊斯兰教也摆脱反动阶级的控制和利用。信徒不仅和全市各族人民一道获得政治上和经济上的翻身解放，而且享受宗教信仰自由的权利。同时，对宗教界人士实行“争取、团结、教育”的方针，团结宗教界的广大爱国人士，支持和帮助宗教界开展国际友好活动。
    60年代中后期，在“文化大革命”中，发生严重违反宗教政策的粗暴行为，把宗教界爱国人士甚至一般信徒，都当作“专政对象”，制造许多冤假错案。
    中共十一届三中全会后，经过拨乱反正和落实宗教政策，政治上平反冤假错案，经济上给予补偿，清退被占的教会房产和寺宇，逐步恢复各教派的宗教活动场所。对宗教场所进行登记管理，使宗教活动趋向正常化；同时恢复各教派爱国团体组织协助宗教团体培养爱国爱教的宗教职业者。至1994年底，福州（五区、六县、二市）有教堂、寺观698座。其中天主教教堂52座；基督教教堂211座（包括点）；佛教寺庙314座；伊斯兰教教堂1座；道教宫观120座。在新的历史时期，中国共产党和人民政府对宗教工作的基本任务，就是要坚定地贯彻执行党的宗教信仰自由的政策，巩固和扩大宗教界的爱国政治联盟，加强对他们的爱国主义和社会主义教育，调动他们的积极因素，为建设现代化社会主义强国，为祖国的统一大业，为反对霸权主义，维护世界和平而共同奋斗。 福州唯一的伊斯兰教寺。在福建福州市安泰桥下。据寺碑刻自称，始建于唐贞观二年（628年），不合史实。按此地原为五代时闽王继鹏的太平官，后晋天福元年（9％年）改为万寿院（佛教），元至正间站归伊斯兰教，改为清真寺。《闽都记》云：国朝初建，名“真教寺”，俗呼“礼拜”，色目人礼拜诵经于此。明嘉靖二十年（1541年）毁于火，是年冬着手重建，越八年始落成。重建的寺，届东方建筑形式；大殿单檐五脊顶，深广均五间，成正方形，为礼拜堂。前有华表，左右两庑为茶厅、房廊、厨舍等。现存大殿为1955年重建，改为工字形。寺内有永乐圣谕、嘉靖重建清真寺记等石碑。福州唯一的伊斯兰教寺。在福建福州市安泰桥下。据寺碑刻自称，始建于唐贞观二年（628年），不合史实。按此地原为五代时闽王继鹏的太平官，后晋天福元年（9％年）改为万寿院（佛教），元至正间站归伊斯兰教，改为清真寺。《闽都记》云：国朝初建，名“真教寺”，俗呼“礼拜”，色目人礼拜诵经于此。明嘉靖二十年（1541年）毁于火，是年冬着手重建，越八年始落成。重建的寺，届东方建筑形式；大殿单檐五脊顶，深广均五间，成正方形，为礼拜堂。前有华表，左右两庑为茶厅、房廊、厨舍等。现存大殿为1955年重建，改为工字形。寺内有永乐圣谕、嘉靖重建清真寺记等石碑。